Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SELENOFO60613 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SELENOFO60613 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SELENOFO60613 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SELENOFO60613 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SELENOFO60613 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SELENOFO60613 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SELENOFO60613 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SELENOFO60613 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SELENOFO60613 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SELENOFO60613 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SELENOFO60613 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SELENOFO60613 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SELENOFO60613 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SELENOFO60613 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SELENOFO60613 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SELENOFO60613 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SELENOFO60613 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SELENOFO60613 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SELENOFO60613 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SELENOFO60613 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SELENOFO60613 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SELENOFO60613 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SELENOFO60613 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SELENOFO60613 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SELENOFO60613 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SELENOFO60613 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SELENOFO60613 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SELENOFO60613 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SELENOFO60613 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SELENOFO60613 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SELENOFO60613 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SELENOFO60613 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SELENOFO60613 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SELENOFO60613 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SELENOFO60613 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SELENOFO60613 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SELENOFO60613 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SELENOFO60613 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SELENOFO60613 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SELENOFO60613 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SELENOFO60613 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SELENOFO60613 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SELENOFO60613 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SELENOFO60613 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SELENOFO60613 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SELENOFO60613 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SELENOFO60613 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SELENOFO60613 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SELENOFO60613 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SELENOFO60613 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SELENOFO60613 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms