Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNT1O60563 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCNT1O60563 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCNT1O60563 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNT1O60563 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms