Protein–RNA interactions for Protein: O60522

TDRD6, Tudor domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD6O60522 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDRD6O60522 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDRD6O60522 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TDRD6O60522 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TDRD6O60522 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD6O60522 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD6O60522 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD6O60522 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD6O60522 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD6O60522 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD6O60522 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD6O60522 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD6O60522 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD6O60522 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TDRD6O60522 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDRD6O60522 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDRD6O60522 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TDRD6O60522 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TDRD6O60522 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TDRD6O60522 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TDRD6O60522 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TDRD6O60522 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TDRD6O60522 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TDRD6O60522 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TDRD6O60522 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD6O60522 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD6O60522 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms