Protein–RNA interactions for Protein: O60224

SSX4, Protein SSX4, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX4O60224 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSX4O60224 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SSX4O60224 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSX4O60224 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSX4O60224 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SSX4O60224 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX4O60224 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX4O60224 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX4O60224 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX4O60224 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SSX4O60224 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX4O60224 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX4O60224 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX4O60224 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX4O60224 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX4O60224 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX4O60224 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX4O60224 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SSX4O60224 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX4O60224 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX4O60224 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX4O60224 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX4O60224 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX4O60224 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SSX4O60224 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX4O60224 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX4O60224 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX4O60224 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX4O60224 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX4O60224 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX4O60224 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX4O60224 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX4O60224 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX4O60224 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SSX4O60224 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX4O60224 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX4O60224 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX4O60224 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX4O60224 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX4O60224 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX4O60224 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX4O60224 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SSX4O60224 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX4O60224 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SSX4O60224 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX4O60224 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX4O60224 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX4O60224 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX4O60224 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX4O60224 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX4O60224 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX4O60224 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SSX4O60224 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX4O60224 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX4O60224 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX4O60224 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX4O60224 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX4O60224 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSX4O60224 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX4O60224 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX4O60224 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX4O60224 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX4O60224 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX4O60224 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX4O60224 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX4O60224 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX4O60224 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX4O60224 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX4O60224 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSX4O60224 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX4O60224 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX4O60224 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX4O60224 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX4O60224 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX4O60224 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX4O60224 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX4O60224 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX4O60224 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSX4O60224 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX4O60224 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX4O60224 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX4O60224 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX4O60224 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSX4O60224 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX4O60224 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX4O60224 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX4O60224 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX4O60224 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX4O60224 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSX4O60224 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX4O60224 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX4O60224 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX4O60224 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX4O60224 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSX4O60224 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX4O60224 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX4O60224 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX4O60224 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX4O60224 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSX4O60224 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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