Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
StrnO55106 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
StrnO55106 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
StrnO55106 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
StrnO55106 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
StrnO55106 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
StrnO55106 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
StrnO55106 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
StrnO55106 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
StrnO55106 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
StrnO55106 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
StrnO55106 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
StrnO55106 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
StrnO55106 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
StrnO55106 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
StrnO55106 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
StrnO55106 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
StrnO55106 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
StrnO55106 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
StrnO55106 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
StrnO55106 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
StrnO55106 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
StrnO55106 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
StrnO55106 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
StrnO55106 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
StrnO55106 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
StrnO55106 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
StrnO55106 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
StrnO55106 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
StrnO55106 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
StrnO55106 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
StrnO55106 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
StrnO55106 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
StrnO55106 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
StrnO55106 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
StrnO55106 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
StrnO55106 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
StrnO55106 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
StrnO55106 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
StrnO55106 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
StrnO55106 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
StrnO55106 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
StrnO55106 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
StrnO55106 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
StrnO55106 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
StrnO55106 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
StrnO55106 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
StrnO55106 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
StrnO55106 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
StrnO55106 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
StrnO55106 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
StrnO55106 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
StrnO55106 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
StrnO55106 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
StrnO55106 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
StrnO55106 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
StrnO55106 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
StrnO55106 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
StrnO55106 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
StrnO55106 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
StrnO55106 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
StrnO55106 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
StrnO55106 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
StrnO55106 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
StrnO55106 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
StrnO55106 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
StrnO55106 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
StrnO55106 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
StrnO55106 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
StrnO55106 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
StrnO55106 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
StrnO55106 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
StrnO55106 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
StrnO55106 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
StrnO55106 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
StrnO55106 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
StrnO55106 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
StrnO55106 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
StrnO55106 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
StrnO55106 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
StrnO55106 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
StrnO55106 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
StrnO55106 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
StrnO55106 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
StrnO55106 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
StrnO55106 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
StrnO55106 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
StrnO55106 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
StrnO55106 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
StrnO55106 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
StrnO55106 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
StrnO55106 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
StrnO55106 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
StrnO55106 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
StrnO55106 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
StrnO55106 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
StrnO55106 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
StrnO55106 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
StrnO55106 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
StrnO55106 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms