Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Copb2O55029 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Copb2O55029 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Copb2O55029 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Copb2O55029 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Copb2O55029 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Copb2O55029 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Copb2O55029 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Copb2O55029 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Copb2O55029 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Copb2O55029 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Copb2O55029 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Copb2O55029 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Copb2O55029 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms