Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SlkO54988 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SlkO54988 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SlkO54988 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SlkO54988 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SlkO54988 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SlkO54988 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SlkO54988 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SlkO54988 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SlkO54988 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SlkO54988 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SlkO54988 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SlkO54988 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SlkO54988 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SlkO54988 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SlkO54988 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SlkO54988 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SlkO54988 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SlkO54988 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SlkO54988 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SlkO54988 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SlkO54988 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SlkO54988 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SlkO54988 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SlkO54988 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SlkO54988 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SlkO54988 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SlkO54988 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SlkO54988 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SlkO54988 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SlkO54988 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SlkO54988 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SlkO54988 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SlkO54988 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SlkO54988 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SlkO54988 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SlkO54988 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SlkO54988 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SlkO54988 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SlkO54988 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SlkO54988 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SlkO54988 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SlkO54988 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SlkO54988 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SlkO54988 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SlkO54988 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SlkO54988 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SlkO54988 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SlkO54988 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SlkO54988 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SlkO54988 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SlkO54988 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SlkO54988 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SlkO54988 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SlkO54988 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SlkO54988 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SlkO54988 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SlkO54988 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SlkO54988 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SlkO54988 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SlkO54988 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SlkO54988 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SlkO54988 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SlkO54988 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SlkO54988 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SlkO54988 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SlkO54988 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SlkO54988 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SlkO54988 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SlkO54988 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SlkO54988 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SlkO54988 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SlkO54988 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SlkO54988 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SlkO54988 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SlkO54988 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SlkO54988 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SlkO54988 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SlkO54988 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SlkO54988 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SlkO54988 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
SlkO54988 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SlkO54988 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SlkO54988 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SlkO54988 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SlkO54988 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SlkO54988 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SlkO54988 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SlkO54988 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SlkO54988 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SlkO54988 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SlkO54988 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SlkO54988 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SlkO54988 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SlkO54988 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SlkO54988 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SlkO54988 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SlkO54988 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SlkO54988 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SlkO54988 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms