Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChkaO54804 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChkaO54804 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChkaO54804 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChkaO54804 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChkaO54804 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ChkaO54804 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChkaO54804 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChkaO54804 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChkaO54804 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChkaO54804 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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