Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CREB3O43889 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB3O43889 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB3O43889 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB3O43889 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB3O43889 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB3O43889 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CREB3O43889 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CREB3O43889 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CREB3O43889 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CREB3O43889 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CREB3O43889 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CREB3O43889 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CREB3O43889 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CREB3O43889 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CREB3O43889 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CREB3O43889 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CREB3O43889 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CREB3O43889 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CREB3O43889 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CREB3O43889 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CREB3O43889 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREB3O43889 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREB3O43889 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREB3O43889 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREB3O43889 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CREB3O43889 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREB3O43889 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREB3O43889 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CREB3O43889 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3O43889 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3O43889 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3O43889 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3O43889 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3O43889 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CREB3O43889 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB3O43889 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB3O43889 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB3O43889 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB3O43889 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB3O43889 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CREB3O43889 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CREB3O43889 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CREB3O43889 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CREB3O43889 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CREB3O43889 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CREB3O43889 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CREB3O43889 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CREB3O43889 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CREB3O43889 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CREB3O43889 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CREB3O43889 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CREB3O43889 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CREB3O43889 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREB3O43889 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREB3O43889 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREB3O43889 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREB3O43889 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CREB3O43889 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREB3O43889 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREB3O43889 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREB3O43889 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CREB3O43889 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CREB3O43889 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB3O43889 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB3O43889 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB3O43889 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB3O43889 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB3O43889 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CREB3O43889 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CREB3O43889 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CREB3O43889 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CREB3O43889 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CREB3O43889 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREB3O43889 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREB3O43889 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREB3O43889 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREB3O43889 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CREB3O43889 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CREB3O43889 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CREB3O43889 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CREB3O43889 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CREB3O43889 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CREB3O43889 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CREB3O43889 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CREB3O43889 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CREB3O43889 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CREB3O43889 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CREB3O43889 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CREB3O43889 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB3O43889 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB3O43889 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB3O43889 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB3O43889 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB3O43889 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB3O43889 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB3O43889 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CREB3O43889 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CREB3O43889 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CREB3O43889 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms