Protein–RNA interactions for Protein: O43731

KDELR3, ER lumen protein-retaining receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3O43731 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KDELR3O43731 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
KDELR3O43731 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KDELR3O43731 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms