Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCP110O43303 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCP110O43303 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCP110O43303 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCP110O43303 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCP110O43303 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCP110O43303 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCP110O43303 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCP110O43303 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCP110O43303 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCP110O43303 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCP110O43303 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCP110O43303 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCP110O43303 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCP110O43303 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCP110O43303 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCP110O43303 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCP110O43303 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCP110O43303 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCP110O43303 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCP110O43303 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCP110O43303 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCP110O43303 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCP110O43303 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCP110O43303 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCP110O43303 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCP110O43303 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCP110O43303 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCP110O43303 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCP110O43303 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCP110O43303 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCP110O43303 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCP110O43303 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCP110O43303 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCP110O43303 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCP110O43303 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCP110O43303 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCP110O43303 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCP110O43303 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCP110O43303 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCP110O43303 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCP110O43303 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCP110O43303 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCP110O43303 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCP110O43303 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCP110O43303 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCP110O43303 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCP110O43303 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCP110O43303 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCP110O43303 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCP110O43303 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCP110O43303 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCP110O43303 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCP110O43303 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCP110O43303 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCP110O43303 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCP110O43303 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCP110O43303 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCP110O43303 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCP110O43303 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCP110O43303 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCP110O43303 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCP110O43303 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCP110O43303 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCP110O43303 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCP110O43303 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCP110O43303 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCP110O43303 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCP110O43303 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCP110O43303 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCP110O43303 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCP110O43303 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCP110O43303 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCP110O43303 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCP110O43303 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCP110O43303 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCP110O43303 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCP110O43303 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCP110O43303 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCP110O43303 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCP110O43303 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCP110O43303 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCP110O43303 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCP110O43303 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCP110O43303 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCP110O43303 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCP110O43303 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCP110O43303 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCP110O43303 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCP110O43303 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCP110O43303 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCP110O43303 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCP110O43303 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCP110O43303 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCP110O43303 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCP110O43303 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCP110O43303 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCP110O43303 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCP110O43303 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCP110O43303 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms