Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdk5r2O35926 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdk5r2O35926 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdk5r2O35926 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdk5r2O35926 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms