Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Kpna6O35345 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kpna6O35345 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kpna6O35345 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Kpna6O35345 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kpna6O35345 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Kpna6O35345 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Kpna6O35345 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kpna6O35345 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kpna6O35345 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kpna6O35345 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Kpna6O35345 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kpna6O35345 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kpna6O35345 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kpna6O35345 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kpna6O35345 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kpna6O35345 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kpna6O35345 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kpna6O35345 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kpna6O35345 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kpna6O35345 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kpna6O35345 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kpna6O35345 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Kpna6O35345 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kpna6O35345 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kpna6O35345 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kpna6O35345 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kpna6O35345 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kpna6O35345 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms