Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bhlhe40O35185 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bhlhe40O35185 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bhlhe40O35185 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms