Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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H2-Q1O19441 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-Q1O19441 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-Q1O19441 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-Q1O19441 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-Q1O19441 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-Q1O19441 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-Q1O19441 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-Q1O19441 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-Q1O19441 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-Q1O19441 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-Q1O19441 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-Q1O19441 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-Q1O19441 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-Q1O19441 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-Q1O19441 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-Q1O19441 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-Q1O19441 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-Q1O19441 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-Q1O19441 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-Q1O19441 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-Q1O19441 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-Q1O19441 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-Q1O19441 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-Q1O19441 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-Q1O19441 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-Q1O19441 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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H2-Q1O19441 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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H2-Q1O19441 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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H2-Q1O19441 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-Q1O19441 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-Q1O19441 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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H2-Q1O19441 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-Q1O19441 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-Q1O19441 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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H2-Q1O19441 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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H2-Q1O19441 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-Q1O19441 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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H2-Q1O19441 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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H2-Q1O19441 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-Q1O19441 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-Q1O19441 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-Q1O19441 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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H2-Q1O19441 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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H2-Q1O19441 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
H2-Q1O19441 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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