Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTLC1O15269 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTLC1O15269 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPTLC1O15269 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTLC1O15269 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms