Protein–RNA interactions for Protein: O15164

TRIM24, Transcription intermediary factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM24O15164 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM24O15164 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM24O15164 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM24O15164 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM24O15164 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM24O15164 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM24O15164 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM24O15164 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM24O15164 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM24O15164 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM24O15164 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM24O15164 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM24O15164 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM24O15164 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM24O15164 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM24O15164 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM24O15164 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM24O15164 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM24O15164 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM24O15164 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM24O15164 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM24O15164 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms