Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BCKDKO14874 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BCKDKO14874 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BCKDKO14874 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms