Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP1O00294 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP1O00294 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP1O00294 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP1O00294 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP1O00294 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP1O00294 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TULP1O00294 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TULP1O00294 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TULP1O00294 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TULP1O00294 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TULP1O00294 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TULP1O00294 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TULP1O00294 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TULP1O00294 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TULP1O00294 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TULP1O00294 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TULP1O00294 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP1O00294 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP1O00294 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP1O00294 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP1O00294 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP1O00294 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP1O00294 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP1O00294 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP1O00294 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP1O00294 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP1O00294 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TULP1O00294 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP1O00294 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP1O00294 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP1O00294 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP1O00294 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP1O00294 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TULP1O00294 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP1O00294 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP1O00294 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TULP1O00294 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TULP1O00294 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TULP1O00294 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TULP1O00294 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TULP1O00294 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP1O00294 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP1O00294 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TULP1O00294 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TULP1O00294 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TULP1O00294 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TULP1O00294 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TULP1O00294 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TULP1O00294 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TULP1O00294 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TULP1O00294 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TULP1O00294 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TULP1O00294 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TULP1O00294 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TULP1O00294 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TULP1O00294 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP1O00294 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TULP1O00294 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP1O00294 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP1O00294 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP1O00294 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP1O00294 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP1O00294 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP1O00294 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP1O00294 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP1O00294 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP1O00294 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP1O00294 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TULP1O00294 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TULP1O00294 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TULP1O00294 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TULP1O00294 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TULP1O00294 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TULP1O00294 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TULP1O00294 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TULP1O00294 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TULP1O00294 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP1O00294 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP1O00294 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP1O00294 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP1O00294 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP1O00294 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP1O00294 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TULP1O00294 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TULP1O00294 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TULP1O00294 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TULP1O00294 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TULP1O00294 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TULP1O00294 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TULP1O00294 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TULP1O00294 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TULP1O00294 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TULP1O00294 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TULP1O00294 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TULP1O00294 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TULP1O00294 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP1O00294 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP1O00294 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TULP1O00294 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms