Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC43.2■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
SUPT5HO00267 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
SUPT5HO00267 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
SUPT5HO00267 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
SUPT5HO00267 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.5
SUPT5HO00267 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC43.18■■■■■ 4.5
SUPT5HO00267 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
SUPT5HO00267 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
SUPT5HO00267 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
SUPT5HO00267 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
SUPT5HO00267 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC43.17■■■■■ 4.5
SUPT5HO00267 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
SUPT5HO00267 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
SUPT5HO00267 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
SUPT5HO00267 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
SUPT5HO00267 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
SUPT5HO00267 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
SUPT5HO00267 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
SUPT5HO00267 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
SUPT5HO00267 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
SUPT5HO00267 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
SUPT5HO00267 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
SUPT5HO00267 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
SUPT5HO00267 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.49
SUPT5HO00267 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.12■■■■■ 4.49
SUPT5HO00267 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
SUPT5HO00267 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
SUPT5HO00267 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
SUPT5HO00267 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
SUPT5HO00267 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
SUPT5HO00267 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
SUPT5HO00267 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
SUPT5HO00267 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
SUPT5HO00267 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
SUPT5HO00267 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
SUPT5HO00267 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
SUPT5HO00267 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
SUPT5HO00267 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
SUPT5HO00267 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
SUPT5HO00267 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
SUPT5HO00267 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
SUPT5HO00267 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
SUPT5HO00267 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
SUPT5HO00267 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
SUPT5HO00267 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.49
SUPT5HO00267 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
SUPT5HO00267 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
SUPT5HO00267 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
SUPT5HO00267 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
SUPT5HO00267 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
SUPT5HO00267 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
SUPT5HO00267 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
SUPT5HO00267 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
SUPT5HO00267 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
SUPT5HO00267 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
SUPT5HO00267 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC43.03■■■■■ 4.48
SUPT5HO00267 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
SUPT5HO00267 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
SUPT5HO00267 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
SUPT5HO00267 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
SUPT5HO00267 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
SUPT5HO00267 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
SUPT5HO00267 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
SUPT5HO00267 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
SUPT5HO00267 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
SUPT5HO00267 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
SUPT5HO00267 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC42.96■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
SUPT5HO00267 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms