Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AP3B1O00203 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AP3B1O00203 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AP3B1O00203 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AP3B1O00203 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms