Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm2888K7N746 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm2888K7N746 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm2888K7N746 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms