Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm2056J3QQ02 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm2056J3QQ02 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm2056J3QQ02 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm2056J3QQ02 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms