Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
BC024978J3QPC3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BC024978J3QPC3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BC024978J3QPC3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BC024978J3QPC3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC024978J3QPC3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BC024978J3QPC3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BC024978J3QPC3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms