Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20825J3QM67 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm20825J3QM67 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20825J3QM67 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms