Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930544D05RikJ3QK56 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930544D05RikJ3QK56 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930544D05RikJ3QK56 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930544D05RikJ3QK56 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms