Protein–RNA interactions for Protein: H3BQB6

STMND1, Stathmin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMND1H3BQB6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
STMND1H3BQB6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STMND1H3BQB6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
STMND1H3BQB6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms