Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf4bG5E8Z2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Taf4bG5E8Z2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Taf4bG5E8Z2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Taf4bG5E8Z2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Taf4bG5E8Z2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Taf4bG5E8Z2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Taf4bG5E8Z2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Taf4bG5E8Z2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Taf4bG5E8Z2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Taf4bG5E8Z2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 732.3 ms