Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nccrp1G3X9C2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nccrp1G3X9C2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms