Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
2610008E11RikG3X964 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
2610008E11RikG3X964 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
2610008E11RikG3X964 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
2610008E11RikG3X964 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
2610008E11RikG3X964 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
2610008E11RikG3X964 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
2610008E11RikG3X964 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
2610008E11RikG3X964 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
2610008E11RikG3X964 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
2610008E11RikG3X964 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
2610008E11RikG3X964 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
2610008E11RikG3X964 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms