Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20517G3UVU6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm20517G3UVU6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20517G3UVU6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20517G3UVU6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20517G3UVU6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20517G3UVU6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20517G3UVU6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms