Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Ercc6F8VPZ5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
Ercc6F8VPZ5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Ercc6F8VPZ5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Ercc6F8VPZ5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
Ercc6F8VPZ5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC38.82■■■■□ 3.81
Ercc6F8VPZ5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Ercc6F8VPZ5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ercc6F8VPZ5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ercc6F8VPZ5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Ercc6F8VPZ5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Ercc6F8VPZ5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Ercc6F8VPZ5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ercc6F8VPZ5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
Ercc6F8VPZ5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ercc6F8VPZ5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ercc6F8VPZ5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ercc6F8VPZ5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Ercc6F8VPZ5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
Ercc6F8VPZ5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Ercc6F8VPZ5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Ercc6F8VPZ5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Ercc6F8VPZ5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
Ercc6F8VPZ5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Ercc6F8VPZ5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Ercc6F8VPZ5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
Ercc6F8VPZ5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Ercc6F8VPZ5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Ercc6F8VPZ5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Ercc6F8VPZ5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
Ercc6F8VPZ5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ercc6F8VPZ5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ercc6F8VPZ5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ercc6F8VPZ5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ercc6F8VPZ5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Ercc6F8VPZ5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Ercc6F8VPZ5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Ercc6F8VPZ5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
Ercc6F8VPZ5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
Ercc6F8VPZ5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Ercc6F8VPZ5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
Ercc6F8VPZ5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Ercc6F8VPZ5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Ercc6F8VPZ5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Ercc6F8VPZ5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Ercc6F8VPZ5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Ercc6F8VPZ5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Ercc6F8VPZ5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Ercc6F8VPZ5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Ercc6F8VPZ5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Ercc6F8VPZ5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ercc6F8VPZ5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ercc6F8VPZ5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Ercc6F8VPZ5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Ercc6F8VPZ5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Ercc6F8VPZ5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Ercc6F8VPZ5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Ercc6F8VPZ5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Ercc6F8VPZ5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Ercc6F8VPZ5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Ercc6F8VPZ5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Ercc6F8VPZ5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Ercc6F8VPZ5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Ercc6F8VPZ5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Ercc6F8VPZ5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Ercc6F8VPZ5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Ercc6F8VPZ5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Ercc6F8VPZ5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Ercc6F8VPZ5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Ercc6F8VPZ5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Ercc6F8VPZ5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Ercc6F8VPZ5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
Ercc6F8VPZ5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
Ercc6F8VPZ5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Ercc6F8VPZ5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
Ercc6F8VPZ5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Ercc6F8VPZ5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Ercc6F8VPZ5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Ercc6F8VPZ5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Ercc6F8VPZ5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Ercc6F8VPZ5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Ercc6F8VPZ5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Ercc6F8VPZ5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Ercc6F8VPZ5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Ercc6F8VPZ5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Ercc6F8VPZ5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Ercc6F8VPZ5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Ercc6F8VPZ5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Ercc6F8VPZ5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Ercc6F8VPZ5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Ercc6F8VPZ5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Ercc6F8VPZ5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms