Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rfx7F8VPJ6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rfx7F8VPJ6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rfx7F8VPJ6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rfx7F8VPJ6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rfx7F8VPJ6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rfx7F8VPJ6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rfx7F8VPJ6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rfx7F8VPJ6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rfx7F8VPJ6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rfx7F8VPJ6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rfx7F8VPJ6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Rfx7F8VPJ6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rfx7F8VPJ6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rfx7F8VPJ6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rfx7F8VPJ6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rfx7F8VPJ6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rfx7F8VPJ6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rfx7F8VPJ6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rfx7F8VPJ6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rfx7F8VPJ6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rfx7F8VPJ6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rfx7F8VPJ6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rfx7F8VPJ6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rfx7F8VPJ6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rfx7F8VPJ6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Rfx7F8VPJ6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rfx7F8VPJ6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rfx7F8VPJ6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rfx7F8VPJ6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rfx7F8VPJ6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rfx7F8VPJ6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rfx7F8VPJ6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rfx7F8VPJ6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rfx7F8VPJ6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rfx7F8VPJ6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rfx7F8VPJ6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rfx7F8VPJ6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rfx7F8VPJ6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rfx7F8VPJ6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Rfx7F8VPJ6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rfx7F8VPJ6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Rfx7F8VPJ6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rfx7F8VPJ6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rfx7F8VPJ6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rfx7F8VPJ6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rfx7F8VPJ6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rfx7F8VPJ6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rfx7F8VPJ6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rfx7F8VPJ6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rfx7F8VPJ6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rfx7F8VPJ6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rfx7F8VPJ6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rfx7F8VPJ6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rfx7F8VPJ6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rfx7F8VPJ6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rfx7F8VPJ6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Rfx7F8VPJ6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rfx7F8VPJ6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rfx7F8VPJ6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rfx7F8VPJ6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rfx7F8VPJ6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Rfx7F8VPJ6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Rfx7F8VPJ6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rfx7F8VPJ6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rfx7F8VPJ6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rfx7F8VPJ6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms