Protein–RNA interactions for Protein: F6S0S7

E130114P18Rik, RIKEN cDNA E130114P18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130114P18RikF6S0S7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E130114P18RikF6S0S7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
E130114P18RikF6S0S7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
E130114P18RikF6S0S7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E130114P18RikF6S0S7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms