Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TrdnE9Q9K5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TrdnE9Q9K5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TrdnE9Q9K5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TrdnE9Q9K5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TrdnE9Q9K5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TrdnE9Q9K5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TrdnE9Q9K5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TrdnE9Q9K5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TrdnE9Q9K5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TrdnE9Q9K5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TrdnE9Q9K5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TrdnE9Q9K5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TrdnE9Q9K5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TrdnE9Q9K5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TrdnE9Q9K5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TrdnE9Q9K5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TrdnE9Q9K5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TrdnE9Q9K5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TrdnE9Q9K5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TrdnE9Q9K5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms