Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DspE9Q557 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DspE9Q557 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DspE9Q557 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DspE9Q557 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DspE9Q557 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DspE9Q557 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DspE9Q557 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DspE9Q557 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DspE9Q557 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DspE9Q557 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DspE9Q557 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DspE9Q557 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DspE9Q557 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DspE9Q557 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DspE9Q557 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DspE9Q557 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DspE9Q557 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DspE9Q557 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DspE9Q557 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DspE9Q557 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DspE9Q557 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DspE9Q557 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DspE9Q557 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DspE9Q557 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DspE9Q557 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DspE9Q557 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DspE9Q557 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DspE9Q557 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DspE9Q557 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DspE9Q557 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DspE9Q557 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DspE9Q557 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DspE9Q557 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DspE9Q557 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms