Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Trappc8E9PWG2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Trappc8E9PWG2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Trappc8E9PWG2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Trappc8E9PWG2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Trappc8E9PWG2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Trappc8E9PWG2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Trappc8E9PWG2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Trappc8E9PWG2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Trappc8E9PWG2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Trappc8E9PWG2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Trappc8E9PWG2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Trappc8E9PWG2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Trappc8E9PWG2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Trappc8E9PWG2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Trappc8E9PWG2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Trappc8E9PWG2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Trappc8E9PWG2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Trappc8E9PWG2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Trappc8E9PWG2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Trappc8E9PWG2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Trappc8E9PWG2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Trappc8E9PWG2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Trappc8E9PWG2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Trappc8E9PWG2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Trappc8E9PWG2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Trappc8E9PWG2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Trappc8E9PWG2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Trappc8E9PWG2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Trappc8E9PWG2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Trappc8E9PWG2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Trappc8E9PWG2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Trappc8E9PWG2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Trappc8E9PWG2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Trappc8E9PWG2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Trappc8E9PWG2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Trappc8E9PWG2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Trappc8E9PWG2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Trappc8E9PWG2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Trappc8E9PWG2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Trappc8E9PWG2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Trappc8E9PWG2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Trappc8E9PWG2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Trappc8E9PWG2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Trappc8E9PWG2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Trappc8E9PWG2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Trappc8E9PWG2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Trappc8E9PWG2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Trappc8E9PWG2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Trappc8E9PWG2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Trappc8E9PWG2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Trappc8E9PWG2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Trappc8E9PWG2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Trappc8E9PWG2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Trappc8E9PWG2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Trappc8E9PWG2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Trappc8E9PWG2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Trappc8E9PWG2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Trappc8E9PWG2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Trappc8E9PWG2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Trappc8E9PWG2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Trappc8E9PWG2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Trappc8E9PWG2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Trappc8E9PWG2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Trappc8E9PWG2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Trappc8E9PWG2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Trappc8E9PWG2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Trappc8E9PWG2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Trappc8E9PWG2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Trappc8E9PWG2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Trappc8E9PWG2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Trappc8E9PWG2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Trappc8E9PWG2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Trappc8E9PWG2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Trappc8E9PWG2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Trappc8E9PWG2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Trappc8E9PWG2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Trappc8E9PWG2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Trappc8E9PWG2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Trappc8E9PWG2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Trappc8E9PWG2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Trappc8E9PWG2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Trappc8E9PWG2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Trappc8E9PWG2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Trappc8E9PWG2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Trappc8E9PWG2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Trappc8E9PWG2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Trappc8E9PWG2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Trappc8E9PWG2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Trappc8E9PWG2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Trappc8E9PWG2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Trappc8E9PWG2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Trappc8E9PWG2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Trappc8E9PWG2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Trappc8E9PWG2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Trappc8E9PWG2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Trappc8E9PWG2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Trappc8E9PWG2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Trappc8E9PWG2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Trappc8E9PWG2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms