Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc62E9PVD1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc62E9PVD1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc62E9PVD1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms