Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim5E9PV98 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim5E9PV98 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim5E9PV98 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim5E9PV98 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms