Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp6ap1lD3Z5W0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms