Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
3425401B19RikD3Z1D3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
3425401B19RikD3Z1D3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
3425401B19RikD3Z1D3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms