Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

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Length 762 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lonrf1D3YY23 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lonrf1D3YY23 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms