Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930444P10RikD3YUR1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930444P10RikD3YUR1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930444P10RikD3YUR1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms