Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PATL2C9JE40 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PATL2C9JE40 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PATL2C9JE40 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PATL2C9JE40 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms