Protein–RNA interactions for Protein: C9J3I9

C5orf58, Putative uncharacterized protein C5orf58, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf58C9J3I9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C5orf58C9J3I9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C5orf58C9J3I9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C5orf58C9J3I9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms