Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kpna7C0LLJ0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kpna7C0LLJ0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kpna7C0LLJ0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms