Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC32

KIF28P, Kinesin-like protein KIF28P, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF28PB7ZC32 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KIF28PB7ZC32 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
KIF28PB7ZC32 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KIF28PB7ZC32 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KIF28PB7ZC32 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms