Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Phf11bB4XVQ1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Phf11bB4XVQ1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms