Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usf3B2RUQ2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usf3B2RUQ2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usf3B2RUQ2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms