Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PtprbB2RU80 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PtprbB2RU80 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprbB2RU80 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms